Tam zamanında (JIT) üretim stratejisinin faydaları iyi belgelenmiştir, ancak bazı ciddi dezavantajları da olabilir. Bu üretim süreci ile ilgili en önemli konu, isminde kanıtlanmıştır. "Tam zamanında", bu iş stratejisinin başarısının büyük ölçüde, hızlı teslimatı sağlamak için işletmeler ve tedarikçileri arasındaki kesin koordinasyona bağlı olduğu anlamına gelir. Envanter tamponu olmadığından, üretimin herhangi bir unsuru ertelenirse iş büyük ölçüde zarar görebilir.
JIT üretim stratejisi, işletmelerin müşteriler tarafından sipariş edilene kadar satış için ürün üretmediği anlamına gelir, yani envanter düşük veya yoktur. Düşük envanter, bir şirketin kâr hanesine çeşitli şekillerde faydalı olabilirken, bir işi bu şekilde yürütmek büyük bir koordinasyon gerektirir. Üretim için gerekli olan hammaddeleri elde etmekten zamanında teslim edilmeye kadar, JIT üretiminin her yönü senkronize edilmelidir. Bu genellikle işletmelerin, siparişler alındığında tedarikçilere otomatik bildirim sağlamak için bilgi teknolojisinin uygulanmasına yatırım yapması gerektiği anlamına gelir.
Standart envanter tabanlı üretim modelleri altında, işletmeler toptancılardan gelen malzemeler için büyük siparişler verir ve birçok ürün tek bir sevkiyattan üretilebilir. Üretim, hammaddelerin ilk sevkiyatını tükettiği için, uygun bir zaman tamponu oluşturan başka bir sipariş gönderilir. İsteğe bağlı üretim, şirketlerin çok kısa sürede küçük, sık siparişleri yerine getirmek isteyen tedarikçiler bulması gerektiği anlamına gelir; bu da genellikle nakliye süresini ve masraflarını azaltmak için yerel tedarikçileri kullanmak anlamına gelir. Envanter veya malzeme stoğu olmadan, herhangi bir tedarik zinciri sorunu teslimat gecikmelerine ve öfkeli müşterilere yol açabilir. Malzeme tedariki, eksiklikler, doğal afet veya siyasi kargaşa (arz şoku olarak adlandırılan) ile ilgili sorunlar nedeniyle hammadde fiyatındaki ani bir artış, bir şirketin müşterilerine etkili bir şekilde hizmet verebilmesi için ciddi bir tehdit oluşturabilir.
JIT üretimi tamamen mevcut siparişlere dayandığından, beklenmedik durumlarla başa çıkmak için en verimli sistem değildir. Bu stratejiyi kullanan bir şirket, bir ürüne olan talepteki ani dalgalanmaları kaldırabilecek donanıma sahip olmayabilir. Yedek envanter eksikliği, müşterilerin şirketin malzeme almasını ve ürünü üretmesini beklemesi gerektiği anlamına gelir. Bu, herhangi bir tedarik zinciri sorunu ortaya çıkarsa, uzatılmış gecikmeler, memnun olmayan müşteriler ve siparişin bir kısmının potansiyel olarak kaybedilmesi anlamına gelebilir.
Büyük siparişleri zamanında yerine getirememek bir iş parasına mal olabilir, ancak JIT stratejisinin doğasında, daha az dramatik olmasına rağmen, aynı derecede önemli olan diğer gizli masraflar vardır. Daha küçük miktarlarda satış yapmak için mal üretmek, hammadde sevkiyatı başına daha az harcama yapmak anlamına gelir, ancak aslında bir şirkete daha fazla mal olabilir. Yüksek üretim seviyelerine sahip işletmeler ölçek ekonomisinden yararlanırlar: üretim arttıkça, her bir ürünün üretim maliyeti ortalama olarak azalır. Bunun nedeni, büyük toptan alımların genellikle cömert miktar bazlı indirimlerle gelmesidir. JIT üretim stratejisini kullanan işletmeler, bu tür fiyat aralıkları için uygun olmayan daha küçük, daha sık sipariş vermeleri gerektiğinden ürün başına daha fazla ödeme yapabilir. Daha sık siparişe eşlik eden ek nakliye ve teslimat ücretleri, hem ürün hem de çevre üzerinde önemli bir etkiye sahip olabilir.